Tout en s'inscrivant dans la politique éducative nationale et académique, le projet d'établissement est l'expression de l'autonomie de l'établissement public local d'enseignement (EPLE) dans son pilotage pédagogique et éducatif.Le projet d'établissement est adopté par le conseil d'administration pour une durée de 3 à 5 ans. Ses résultats doivent être régulièrement évalués et ses actions réajustées en lien avec le rapport d'auto-évaluation, le rapport d'évaluation et le contrat d'objectifs.
Pour le lycée de la Mare Carrée, le projet d'établissement a été réécrit lors de l'année scolaire 2023-2024. Il sera valable pour la période 2024-2028.